1、治疗方法不当，没有全面详细肠镜检查准确诊断，忙目用药，忙目治疗，易引起误诊、误治，目前治疗结肠炎的药物不少，但主要是以抑菌消炎为目的，只能治标，不易治本。

    2、抑茵后难以重建新的菌群平衡，病情发作期使大量抗生素虽然可以消除症状减轻病痛，但大剂量抗菌素在抑菌的同时会对肠道内的正常菌群造成不利影响，肠道内生态平衡严重失调，使结肠彻底失去抗病菌能力，从而反复发作。

    3、缺少对免疫病因的治疗，结肠炎是机体免疫功能异常引起的自身免疫性疾病，因此，在对症治疗的同时必须重点针对免疫功能异常。